低倍物镜有相当大的前组镜片，能用缠在手指上的棉布或棉签及擦镜纸上用乙醇沾湿来擦拭 。40X、100X需多加小心地用放大镜仔细检查 。高倍镜中为了达到高的平坦度，应用了一个有小曲率半径凹面的前组镜头，在擦拭这组镜头时用带有棉球的牙签或棉花签清洁 。擦拭镜头表面要轻 。不要过度用力和有刮擦动作，并确信棉签触到镜头的凹面 。在清理后用放大镜检查物镜是否损伤，如果必须要去开观察镜筒，小心不要接触到镜筒下面的外露镜头，镜头表面如有手指印会降低成像的清晰度，用清洁物目镜的方法进行擦拭 。
当显微镜使用100X油镜使用完时，请及时将油镜表面擦拭清楚并检查40X物镜是否沾上油，如有请及时擦清 。使显微镜始终保持成像清晰 。
仪器的维护
使用防尘罩是保证显微镜处于良好机械和物理状态的最重要的因素 。显微镜的外壳如有污迹，能用乙醇或肥皂水来清洁（无用其他有机溶剂来清洁），但切勿让这些清洗液渗入显微镜内部，造成显微镜内部电子部件的短路或烧毁 。
保持显微镜使用场地的干燥，当显微镜长期工作在湿度较大的环境中，还是容易增加霉变的几率，因此如显微镜不得不工作在这些湿度较大的环境中，建议使用去湿机 。另外，如发现光学元件表面有雾状，霉斑等不良情况时，请立刻联系专业人士，对您的显微镜进行专业维护保养 。
仪器保养注意事项
采取下列措施，或许能更好的延长您的显微镜使用时间并使之保持良好的工作状态 。
（1）每次关闭显微镜电源前，请将显微镜灯光调至最暗 。
（2）关闭显微镜电源后，请等灯箱完全冷却后（约15分钟后），在罩上显微镜防尘罩 。
（3）开启显微镜电源后，若暂时不使用，可以将显微镜灯光调至最暗，而无需频繁开关显微镜电源 。
显微镜工作一年后，应每年至少做一次的专业维护保养 。
仪器日常使用注意事项
1.搬动显微镜时，要一手握镜臂，一手扶镜座，两上臂紧靠胸壁 。切勿一手斜提，前后摆动，以防镜头或其他零件跌落 。
2.观察标本时，显微镜离实验台边缘应保持一定距离(5cm)，以免显微镜翻倒落地 。镜柱与镜臂间的倾斜角度不得超过45度，用完立即还原 。
3.使用时要严格按步骤操作，熟悉显微镜各部件性能，掌握粗、细调节钮的转动方向与镜筒升降关系 。转动粗调节钮向下时，眼睛必须注视物镜头 。
4.观察带有液体的临时标本时要加盖片，不能使用倾斜关节，以免液体污染镜头和显微镜 。
5.粗、细调节钮要配合使用，细调节钮不能单方向过度旋转，调节焦距时，要从侧面注视镜筒下降，以免压坏标本和镜头 。
6.用单筒显微镜观察标本，应双眼同时睁开，左眼观察物像，右眼用以绘图，左手调节焦距，右手移动标本或绘图 。
7.禁止随意拧开或调换目镜、物镜和聚光器等零件 。
8.显微镜光学部件有污垢，可用擦镜纸或绸布擦净，切勿用手指、粗纸或手帕去擦，以防损坏镜面 。
9.凡有腐蚀性和挥发性的化学试剂和药品，如碘、乙醇溶液、酸类、碱类等都不可与显微镜接触，如不慎污染时，应立即擦干净 。不要任意取下目镜，谨防灰尘落入镜筒 。
10.使用油镜观察样品后，随即用二甲苯将油镜镜头和载波片擦净，以防其他的物镜玻璃上沾上香柏油 。二甲苯有毒，使用后马上洗手 。
11.实验完毕，要将玻片取出，用擦镜纸将镜头擦拭干净后移开，不能与通光孔相对 。用绸布包好，放回镜箱 。切不可把显微镜放在直射光线下曝晒 。
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