饲料贮存间要通风透气，需暂时贮存的饲料也可均匀加入防霉剂进行防霉，适当增喂一些复合多维、电解质、微生态制剂及免疫增强剂等，以增强机体的抗应激能力和抵抗力 。相应增加饲料中的维生素含量，如维生素A、维生素E、维生素D、维生素B等来加强畜禽对环境的抵抗力 。也可通过添加微生态制剂来调节畜禽自身的微生态环境，起到抗病效果 。严格控制好饮水质量 。洪水过后，为了保证家禽能够饮用到干净的水，可通过饮水消毒的方法解决 。
4科学防范疫病
水灾后不宜立即补栏，在为补栏做准备的同时，要观察了解本场及周围畜禽养殖场的健康状况一切正常后，方可考虑引种补栏 。
水灾后极易发生各类疫情，加强灾后畜禽的疫病监控，特别是怀疑有炭疽、口蹄疫等烈性动物传染病时，应立即上报，并对疫区或疫点进行封锁、隔离和消毒 。对当地曾发生过的疫情和目前流行的疫情要密切监控，并可提前做好相关疫苗补（复）免 。对动物出现的腹泻、霉变饲料中毒、瘤胃酸中毒等疾病加强预防并对症处理 。水灾后易诱发畜禽寄生虫病，定期对灾区畜禽寄生虫病开展检测，在饲料中添加左旋咪唑、伊维菌素等驱虫药物驱除体内寄生虫 。
在畜禽入舍前一定要做好疫苗接种工作，同时组织开展灾后免疫注射 。被洪水淹没过的禽舍，各种致病菌及病毒无处不在，而且有些传染性很强 。为防止灾后牲畜口蹄疫、猪瘟、猪链球菌、禽流感等重大疫情发生，应严格执行强制免疫措施，对重大疫病实施紧急免疫，要确保免疫密度，提高免疫保护水平 。接种时要严格按操作规程进行，不能漏针及注射量不足，对要求加强免疫的疫苗应复种 。此期还须在饲料中添加亚硒酸钠及维生素E，维生素E的抗氧化性可提高机体的免疫力，亚硒酸钠与维生素E合用可显著提高畜禽免疫力 。同时，亚硒酸钠与维生素E缺乏时会导致免疫失败 。
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