2、消毒剂
1、氯酸盐：开始抑制浓度（以氯酸钾为例）约为0. 001一0. 01mmol/ L （约为0.1225-1.225mg/L）；完全抑制浓度以ClO3-浓度计为1一10mmo l/ L 时, 硝化菌被完全抑制 。
2、亚氯酸盐：亚氯酸盐浓度为 3 mmol/ L 时 , 硝酸菌能完全被抑制 。
3、（重）金属类
当水中受到Cr、Cd、Cu、Zn、Pb、Ag、As等重金属污染过高时，硝化作用会受到抑制，其原因可能是重金属对硝化过程中的酶活性产生影响，从而影响硝化细菌的转录等正常的生理过程，导致硝化菌硝化效率下降甚至死亡 。
有学者Hg 主要表现为抑制生物大分子如蛋白质和核酸的合成, 致突变效应, 停止细胞分裂, 抑制生物氧化及运动性 。Pb可造成细胞膜损伤, 破坏营养物质的运输 。Cd 致突变效应, 导致DNA 链断裂 。高浓度Mn干扰细胞对 Mg（Ⅱ）的运输 。铜离子螯合巯基，干扰细胞蛋白质或酶的结合；六价铬通过细胞膜的硫酸盐通道进入细胞，细胞质内六价铬还原成三价铬时产生的氧化应激，造成蛋白质和 DNA 损伤 。部分重金属对硝化的抑制作用效果大致如下： EC50：半数效应浓度，引起受试对象50%个体产生一种特定效应的药物剂量 。
IC50:半数抑制浓度，一种药物能将细胞生长、病毒复制等抑制50%所需的浓度 。
4、苯酚
苯酚对硝化有抑制作用 , 该抑制属非竞争性抑制, 是可逆的 。苯酚2,4-二氯酚共存时产生叠加抑制效应 。多位学者研究均表明，苯酚对硝化反应的半数抑制率，即IC50约为20mg/L 。
5、硝化抑制剂
在农业上，通常会在氮肥中施加硝化抑制剂，以抑制肥料中的氮元素硝化损失肥效，这些硝化抑制剂对硝化过程均有明显的抑制作用，主要有：ATC（4-氨基-1,2,4-三唑）、叠氮化钾、2-氯-6-（三氯甲基）吡啶、2-氨基-4-氯-9-甲基吡啶、磺胺噻唑、双氰胺、硫脲-N-2，5-二氯苯丁二酰胺、4-氨基-1，2，3-三唑盐酸盐、脒基硫脲等 。
这些物质一般属于含硫化合物、N杂环化合物、双氰胺类化合物 。这些物质由于其本身特殊的化学结构，在硝化过程中影响氨单加氧酶(AMO)的氧化过程，从而会对硝化过程产生影响 。在农业上一般使用这些硝化抑制剂时，投加量约为总氮量的0.1%—1%，就可以对硝化过程产生明显的抑制作用 。
四、硝化系统异常问题的分析与排除
现象一：硝化系统混合液的pH降低，硝化效率下降，出水NH3-N浓度升高 。
其原因及解决对策如下：
① 碱度不足 。检查二沉池出水中的碱度，如果小于20mg/L，则可判定系碱度不足所致，应进行碱度核算，确定投碱量 。
② 入流污水中的酸性废水排放 。检查入流污水的 pH，如果太低，可说明有酸性废水排入，可采取石灰中和处理等临时措施，并同时加强上游污染源管理 。
现象二：混合液pH值正常，但硝化效率下降，出水NH3-N浓度升高 。
其原因及解决对策如下：
① 供氧不足 。检查混合液的DO值是否小于2mg/L，如果DO太低，可增加曝气量 。
② 温度太低 。检查入流污水或混合液的温度是否明显降低，影响了硝化效果 。解决对策可以有增加投运曝气池数量或提高混合液浓度ML VSS 。
③ 入流TKN负荷太高 。检查入流污水中的TKN浓度是否升高 。如果升高，则应增加投运曝气池数量或者提高曝气池的MLVSS，并同时增大曝气量 。
④ 硝化菌数量不足 。首先检查是否排泥过量，如果排泥量太大，则减少排泥量；其次检查是否由于某种原因导致二沉池飘泥，造成污泥流失，并采取控制对策 。如果非以上两个原因，则检查是否入流污水的BOD5/TKN太大，使MLVSS中硝化菌比例降低 。可以增大初沉池停留时间，降低BOD5/TKN值 。
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