软件著作权 ， 是指软件的开发者或者其他权利人依据有关著作权法律的规定 ， 对于软件作品所享有的各项专有权利 。就权利的性质而言 ， 它属于一种民事权利 ， 具备民事权利的共同特征 。
软件著作权是在软件创作完成后产生的 ， 按照中国现行的著作权法 ， 不登记理论上你也拥有该软件的著作权 ， 另外也可以进行软件著作权登记 ， 经国家版权局认证以后起到公证的效力 。
软件专利 ， 是指通过申请专利对软件的设计思想进行保护的一种方式 ， 而非对软件本身进行的保护 。从客观情况来讲 ， 软件的专利保护实际操作上比较麻烦 ， 也就是程序上不像著作权 ， 直接备案登记的 ， 即使 ， 著作权人不登记备案 ， 只要是你自己创作的就当然地取得该创作的著作权的 。软件专利保护可以在你有某个完好的创意的时候就可以申请了 ， 就算该发明还没有最终成功完成 。因为在专利保护上 ， 我国实行先申请制度的 ， 谁申请在先 ， 谁就享有该专利权 。
第一：依据的法律不同
软件的著作权保护依据《著作权法》和《计算机软件保护条例》 。
软件的专利保护依据《专利法》 ， 具体审查标准参见国家知识产权局专利《审查指南》第二部分第九章“涉及计算机程序的发明专利申请审查若干问题” 。
第二：保护原则不同
软件著作权是在软件创作完成后自动产生的 ， 也是自愿进行软件著作权登记 ， 登记的目的是体现公证的效力 ， 主要用于声明著作权权属 ， 同时使后续维权时的证据力度更大 。
软件专利则必须向专利局提出申请才能获得保护 ， 因此必须要积极申请 ， 且专利制度也是以“用公开换保护”为原则 。
第三：保护客体不同
软件著作权申请提交的资料是源代码及用户操作手册 ， 所以软件著作权保护的是表现形式 ， 不保护思想 。
这样就有可能出现竞争对手将你的软件进行研究 ， 然后改变编程语言 ， 达到的结果是一样的 ， 但由于代码不相同 ， 所以不侵犯著作权 。
软件专利则不同 ， 在申请时描述的是软件的设计构思（注意一定要以技术方案的形式表现 ， 或者最好能够结合硬件来表现） ， 包含了软件流程图的内容 ， 而不是主要说明采用哪种程序语言实现 。一旦获权后 ， 他人只要采用了软件专利的设计构思或方案 ， 就可能构成侵权 。
第四：申请通过率不同
软件著作权实行的是登记制 ， 一般不需要经过实质审查 ， 只要形式审查时提交的材料符合要求 ， 并且不违反《著作权法》的规定即可获权 ， 登记通过率极高 。
软件专利需要经过形式审查和实际审查 。
形式审查主要是审核专利材料是否符合申请要求 ， 形式审查通过后就会公开 ， 再进入实质审查 ， 审核该专利是否符合《专利法》的要求 ， 并且要满足新颖性 ， 创造性 ， 实用性等诸多要求 。
一般纯软件型的专利不易获权 ， 通过软硬件结合的方式会提高其授权率 ， 但总得来说通过率依然不高 。
第五：保护期限和维护费用不同
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