传统文化如同衣服上的纹饰，有的绣着龙，有的绣着狮子，有的绣着一头大河马，那都是装饰 。科学是衣服的里子，是御寒的 。无论衣服外面是怎么样子的纹饰，只要里子不坏，这件衣服的功能就达到了御寒的效果 。至于外面的纹饰绣着龙的，想着换一个绣着狮子的，那都是无关紧要的事情 。不会因为你换了一个纹饰，这件衣服的御寒效果就不一样了 。除非在衣服上面钻孔打洞，非要弄一件丐装，那是反科学，比如神学巫术玄学，专门在衣服上钻孔，费尽心思想把里子换掉 。
赵南元描述过，科学肇始之初，曾为“神学的婢女”，其任务在于证明“上帝的伟大和光荣” 。牛顿定律可以解释太阳系各行星的径向加速度，却对切向初速度无能为力，只能将其归结为“上帝的第一推动”，使得《原理》也对上帝有所交差 。然而科学一旦诞生，其自身的规律使其不得不摆脱神学的束缚，使唤丫头（婢女）公然造反，把上帝贬成了“多余的假说”（拉普拉斯语），科学和神学（西方最正宗的传统文化）从此分道扬镳 。可能是基于这样的历史情结（其实是源于科学本身的性质），在科学的论述中形成了一个重要的规则：不能使用“传统文化”作为证据 。无论你是什么教徒，都不能在科学的论文中依据自己的“传统文化”展开议论 。这个规则不仅保障了科学的明确性，也有助于科学能够成为跨越国籍、种族、文化、阶级、宗教、意识形态的通用学问 。或者说，科学可以“扎根于”任何东西（当然包括“传统文化”），但是其论证不能依靠这些东西，必须遵循科学自身的论证规则 。所以，受梦中白蛇舞动的刺激而发现苯环结构的凯库勒不会在论文中提及“扎根于梦蛇的原创性成果” 。
另一个例子是印度数学天才拉马努金 。人们惊讶其不断提出新定理，问他怎么想出来的 。拉马努金说是一个婆罗门教的女神在梦里告诉他的 。尽管如此，按照科学的规则，定理是否正确仍然需要依靠常规的数学证明，不因其“扎根于传统文化深厚土壤上的挑战性的科技原创性成果”而获得任何特殊待遇 。拉马努金也不会称自己的数学是“东方数学”、“印度数学”或者“女神数学” 。
西方的伪科学推行者们明白科学的规则，总是费尽心机地撇清或掩盖他们和“传统文化”的密切关系 。例如2005年美国出现了堪萨斯州教育委员会试图把“智能设计论”塞入基础教育课本的伪科学事件 。美国38位诺贝尔奖得主发表联名信坚决反对这种改头换面的神创论 。作为阶段性的结局，美国宾夕法尼亚州联邦地区法院2005年2月20日作出裁决，认为“智慧设计论”系宗教理念，在公立学校科学课上讲授该理论属于违宪 。
在美国，是科学一方着重指出“智慧设计论”就是神创论的变形，而伪科学一方则极力否认“智慧设计论”与神创论（正宗传统文化）的关系，并不利用宗教或民族主义激情来支持伪科学 。而在中国，伪科学却高举“传统文化”的大旗，利用民族主义激情来对抗科学理性 。
这种区别产生于东西方文化背景的区别 。中国传统文化大致可以分为儒、释、道三家 。占主流地位的儒家，遵循孔子的“知之为知之，不知为不知”的传统，不提倡“强不知以为知”，对于不知道的事不去硬造 。所以对于宇宙起源、人类起源、死后的世界等问题的解答留给了民间神话，没有形成自己的权威解释 。加之儒家重视人际关系，不关心认识自然（吾不如老圃），对于自然的知识也积累不多，所以很难和科学发生正面冲突，而容易和平相处 。这也是科学进入中国能够畅行无阻的原因之一 。
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