根肿病和根结线虫都为害蔬菜根系，主要表现都是植株矮化、叶片发黄、萎蔫，若不能正确区分，就可能进入误区，错过最佳治疗 。
一、根肿病只发生在十字花科作物，侵染主侧根，在主根上发病时，肿瘤比较大，数目较少，在侧根上发生时肿瘤比较小，数目相对偏多，受害后形成大小不等的肿瘤；根结线虫既为害十字花科也为害其他作物，主根发病较少，主要为害作物的须根和侧根，受线虫刺吸为害和通过受伤根系维管束为害，形成大小不一肿瘤，为念珠状 。
二、根肿病的根是根组织膨大成结肠状，而根结线虫病则是在细根上形成小瘤，呈念珠状 。
三、通过显微镜观察，根肿病是菌，解剖后没有虫体，而根结线虫在显微镜下是虫体 。
四、根肿病原菌为鞭毛菌亚门真菌中的芸苔根肿菌，主要适宜酸性土壤，尤其十字花科重茬地块或地势低洼的地块易发病，土壤为pH值7.2，呈弱碱性时就是有根肿病菌也不宜发病 。根结线虫是卵和幼虫残留在植物残体，主要分布在土壤3～10厘米土壤中，对土壤酸碱度没有绝对要求，尤其板结和透气性较差地块易发病 。
五、根肿病为鞭毛菌，可用福美双、甲霜灵霜霉威、氰霜唑、氟啶胺杀菌剂防治，而根结线虫要用阿维菌素、噻唑磷、氟吡菌酰胺杀虫剂防治 。
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