广州市作为广东省首批试点应用城市，2019年6月14日全市首发，16家机构启动应用健康码，2019年8月28日第二批20家医院和2个区上线 。
第一批：
中山大学附属第一医院
中山大学附属第三医院
中山大学附属肿瘤医院
暨南大学附属第一医院
广东省人民医院
南方医科大学南方医院
南方医科大学珠江医院
广州中医药大学第一附属医院
广州市第一人民医院
广州市妇女儿童医疗中心
广州市红十字会医院
广州市皮肤病防治所
广州医科大学附属第一医院
广州医科大学附属第二医院
广州医科大学附属第五医院
广州市番禺区中心医院
【广州电子健康码适用医院名单汇总】第二批：
中山大学孙逸仙纪念医院
中山大学附属第六医院
中山大学附属口腔医院
广东省中医院
广东省第二人民医院
广东省第二中医院
南方医科大学第三附属医院
广州市中医医院
广州市第八人民医院
广州市胸科医院
广州市惠爱医院
广州市第十二人民医院
广州医科大学附属第三医院
广州医科大学附属肿瘤医院
广州医科大学附属口腔医院
广州市番禺区中医院
广州市越秀区儿童医院
广州市越秀区第二中医医院
广州市越秀区口腔医院
广州市海珠区妇幼保健院
黄埔区(1家卫生院和9家社区卫生服务中心)：
黄埔区九龙镇中心卫生院
黄埔区黄埔街社区卫生服务中心
黄埔区穗东街社区卫生服务中心
黄埔区鱼珠街社区卫生服务中心
黄埔区东区街社区卫生服务中心
黄埔区夏港街社区卫生服务中心
黄埔区永和街社区卫生服务中心
黄埔区联和街社区卫生服务中心
黄埔区长洲街社区卫生服务中心
黄埔区红山街社区卫生服务中心
南沙区(6家医院和8家社区卫生服务中心)：
广州市南沙区第二人民医院
广州市南沙区第六人民医院
广州市南沙区中医医院
广州市南沙区妇幼保健院
广州市南沙区灵山医院
广州市南沙区新沙医院
广州市南沙区大岗镇社区卫生服务中心
广州市南沙区南沙街社区卫生服务中心
广州市南沙区万顷沙镇社区卫生服务中心
广州市南沙区珠江街社区卫生服务中心
广州市南沙区黄阁镇社区卫生服务中心
广州市南沙区横沥镇社区卫生服务中心
广州市南沙区榄核镇社区卫生服务中心
广州市南沙区东涌镇社区卫生服务中心
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