作为学科教学的精髓和灵魂，学科思想方法具有以下几个基本特征：(1)深刻性 。学科思想方法反映了学科内在的规律和特点，体现了学科知识的本质和价值，引导着学科的发展和充实，学科的许多具体内容都可在学科思想方法的框架下得到解释，因而具有深刻性 。(2)内隐性 。学科思想方法不是具体的学科知识，而是从具体的学科知识之中提炼出来的，常常蕴涵于学科概念、法则、定律等基础知识的形成过程中，因而具有内隐性 。(3)稳定性 。学科思想方法是对学科知识内容和所使用方法的本质的认识，它是从某些具体学科认识过程中提炼出来的一些观点，在后继研究和实践中被反复证实其正确性之后，就带有了一般意义和相对稳定的特征 。(4)整合性 。作为学科的深层结构，学科思想方法以基本观念和基本方法为核心，是学科知识结构的组织线索和转换依据，对学科的知识体系、教师的教学内容、学生的学科学习和学科能力发展都具有整合功能，因而具有很强的整合性 。
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为什么要基于学科思想方法整合学科教学?
今天的时代是知识剧增的时代，各个学科在加紧分化的同时又在加强综合，这不仅使知识总量急剧增长，而且还使学科知识不断推陈出新 。相应地，儿童需要掌握的知识远远超过了以前的同龄儿童 。如何以学科的本质和核心来建构和整合学科知识体系，克服知识的片断化和“短暂性”，解决现代知识和儿童学习内容的“过量”问题，就成为课堂教学深化改革必须面对的一个重大课题 。笔者以为，解决这个课题的一种选择就是必须基于学科思想方法整合学科课堂教学 。不仅如此，倡导和推行“基于学科思想方法的整合性教学”对于我国当下正在向纵深推进的素质教育改革还具有重要的现实意义 。
我国从上世纪80年代就提出了素质教育改革的问题，但经过二十多年的实践，情况仍然不容乐观 。教师的教学庞杂、零散而缺乏整合;学生的学习费时、低效而停留于浅表的水平 。依靠大量讲解和“题海战术”获取高分的状况没有根本改变，学生的课业负担更是有增无减 。其中一个重要原因就是忽视了学科思想方法的教学，致使教学在知识和技巧的水平上运行，降低了教学的有效性和学生学习的质量 。强调以学科思想方法整合学科课堂教学，就是要为实现学科教学内容“量”的压缩和“质”的精选，为解决学生局部认识和整体认识的矛盾，为克服教学内容的分散性与教学过程的间断性，并为切实减轻学生课业负担，促进学生探究性学习能力、创造性思维和学科综合素养发展找到一个现实的突破口 。
具体地说，基于学科思想方法整合学科课堂教学在减轻学生学习负担和提升学生学习质量方面具有四个突出的优点：(1)有助于学生记忆知识 。基于学科思想方法整合学科教学，“可以把现行的极其丰富的学科内容精简为一组简单的命题，成为更经济、更富活力的东西 。”[10](2)有助于学生对整个学科的理解与把握 。基于学科思想方法整合学科教学，可以帮助教师以学科的基本观念、关键概念和方法论原理建构和组织学科内容，把教学建立在深度的思维水平之上，从而方便学生真正理解和把握整个学科的基本结构 。(3)有助于学生的知识迁移和运用 。基于学科思想方法整合学科教学，学生不仅可以简单明确地把握学科内容，而且还可以发展迁移运用的能力，对相互关联的未知事物迅速做出预测 。(4)有助于学生从事探究性学习 。基于学科思想方法整合学科教学，可以帮助学生通过对学科深层结构的理解来训练他们“分析信息，提出新命题，驾驭知识体系的能力”[11]，能够使学生超越学科课堂教学所提供的知识范围，赋予学生展开探究性学习活动的机会，进而达到培养学生创造性思维的目的 。
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