只有培育无病壮苗，才是丰产丰收的基础，由于番茄等果类蔬菜种子表面经常带有早晚疫病、炭疽病、枯萎病、病毒病等病菌，带菌的种子播种后会传染给幼苗和成株，从而导致病害的发生 。因此，在育苗前对种子进行消毒处理，是预防病害的一个很重要的环节 。
育苗时常用的种子消毒措施有温汤浸种和药剂浸种两种主要方法 。
温汤浸种
温汤浸种就是用50-55℃恒温热水来浸泡种子 。由于55℃是大多数病菌的致死温度，在此温度下浸种15-20分钟，种子上的绝大多数病菌能够被杀灭掉 。因此，温汤浸种是一种对种子进行消毒的较好方法 。
温汤浸种的具体操作过程如下：先用温水把种子预浸30分钟左右，使种子上携带的病菌吸水活跃起来，以利于杀灭 。然后把种子浸入55℃热水中，并不断加入热水保持恒温 。为了保证温度的均衡，需不断搅拌 。在此温度下烫种15-20分钟，然后加入冷水降至25-30℃ 。即可达到种子消毒的目的 。
药剂浸种
【如何对番茄种子进行消毒】药剂浸种就是把杀菌消毒剂配成一定浓度，用以浸泡种子，对种子的表皮及内部组织进行消毒的方法 。在药剂消毒前，先把种子在水中预浸10分钟，再进行消毒处理 。
常用的消毒方法有以下几种：
福尔马林消毒：先把种子在清水里浸泡3-4小时，捞出放入100倍的福尔马林溶液中，浸泡15-20分钟后捞出，用清水冲洗干净，能杀死种子表面携带的枯萎病菌 。
磷酸三钠消毒：用10％的磷酸三钠浸种10-15分钟，捞出用清水洗净 。可除去种子携带的病毒 。
高锰酸钾消毒：用0.1％的高锰酸钾消毒处理20-30分钟，再用清水冲洗几遍，有钝化病毒和杀菌的作用 。
用1000倍液的咪鲜胺浸种10-15分钟，捞出用清水洗净，可除去种子携带的炭疽病菌 。
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