质量保证金的扣留手续，主要有两种：
1、逐次扣留，即发包人在支付工程进度款时按比例逐次扣留；
2、一次性扣留，即发包人在工程竣工结算时一次性扣留质量保证金 。
法律依据：
《合同法》第二百八十一条
【工程质保金的扣除手续有哪些】因施工人的原因致使建设工程质量不符合约定的，发包人有权要求施工人在合理期限内无偿修理或者返工、改建 。经过修理或者返工、改建后，造成逾期交付的，施工人应当承担违约责任 。
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